水产研究所成立于2018年，主要开展水产新品种引进、培育、示范与推广；涪江及长江上游经济保护鱼类的生态保种、繁育、保护及开发利用；水产动物病害防治技术研究及推广应用；水产微生态制剂研发及推广应用；渔业资源调查、水生生物影响评价、渔业技术咨询、服务、培训等工作。
现有专业技术人员6名，其中高级职称3人，博士学历1人，硕士学历5人。
近年来累计承担省、市等各级项目20余项，获得实用新型专利5项、发表论文20余篇；开发功能性微生态制剂8种，成功实现市场转化5种；与企业紧密结合，长期担任渔药企业技术顾问，实质参与企业经营管理和市场服务，与企业签订技术合作与服务协议7项，创造了较好的经济价值；每年解决水产动物病害防治问题100人次以上。
